馬祖馬拉松今年特別將國共內戰70年間中共解放軍攻不下來的許多重要軍事據點開放，列為比賽必經賽道，包括專為馬拉松賽開放的南北坑道，主辦比賽的連江縣縣長劉增應還特別促銷馬祖十大美食，希望參賽跑者能親身體驗，品嘗好口味。
位於閩東的馬祖列島，自古以來就因地理位置的因素成為兵家必爭之地，在中華民國政府遷台後，馬祖就成了兩岸對峙最前線，也因為這樣的時空背景留下了許多軍事設施，因此讓參賽的跑者們不只能跑在戰車的車道上，更希望透過跑馬過程飽覽馬祖自然美景風光及人文氣息，賽事沿途經過北海坑道、鐵堡、12據點、大砲連等南竿島最著名的軍事景點，以及每年只為馬祖國際馬拉松才開放的南北坑道，讓跑者們能身歷其境彷若身處戰地中。
沿途的補給站參賽選手也將體驗馬祖在地特色美食，包含：紅糟雞塊、紅糟香腸、繼光餅等，讓來馬祖的跑者們能邊吃邊玩。連江縣縣長劉增應表示：「2020年將發揮過去累積五年的經驗，將賽道更加的優化，把南竿各村全部涵蓋。同時，賽事現場也將提供馬祖十大美食，讓來參賽的跑友們能更值回票價。」
馬祖馬拉松可以見證國共內戰的慘烈，圖為有名的大漢據點。