鑑於近期國際情勢的重大發展，包括美國總統大選以及中共五中全會，對美中及兩岸關係皆有廣泛而深遠的影響，蔡總統在上月已指示國安會組成專案小組，就相關情勢的可能發展，進行持續掌握及分析研判，並就各種可能狀況沙盤推演，預為因應部署。
總統也在今（31）日上午召開國安高層會議，就中國軍事威脅與區域安全、持續深化臺美關係、穩定兩岸關係、國內政經穩定及安全、未來經濟發展等五個面向做出裁示。
總統指出，面對全新情勢與可能的挑戰，政府將會在堅守、捍衛民主自由價值的原則下，繼續深化、鞏固臺美關係，堅定維護臺海和平穩定；政府有信心、也有能力應對各種不同的狀況，請全體國人放心。而總統裁示如下：
一、中國軍事威脅與區域安全
總統表示，這段時間，中國解放軍在臺海、南海乃至東海日益頻密的軍事活動，對區域安全情勢已造成衝擊，作為區域一員，臺灣將持續善盡責任。證諸歷史，示弱退讓從不會帶來和平，只有堅實的防衛決心和實力，才能捍衛家園。
對於近期以來共軍在區域間的軍事作為，國防部、國安會應妥為掌握，並針對各種可能的威脅風險縝密評估，務必有萬全準備。我國也將持續強化防衛戰力的現代化，提升不對稱戰力、推動國防自主，以及後備動員制度改革，以因應對岸軍事擴張及挑釁。
二、持續深化臺美關係
總統表示，近期以來，臺灣得到美國主流民意，以及朝野政黨的一致支持。美國國會已經通過「臺灣旅行法」、「臺北法案」、「臺灣保證法」等多項法案；行政部門也有多位高層官員訪臺，也通過多次軍售案，臺美關係的進展，國人有目共睹。
臺美關係是我國外交工作的重中之重，無論選舉結果為何，持續深化與美國共和黨及民主黨之關係，爭取美國跨黨派持續對民主臺灣的一致支持，就是我們推動臺美關係發展的首要目標。
總統指示國安會、外交部、駐美代表處要持續加強對美外交工作，包括相關情勢發展的有效掌握、美國朝野各界對臺支持的爭取，以及進行中重要政策方案的穩健進行，就未來幾個月最優先工作項目，積極落實執行。
臺灣和美國是理念和價值的同盟，相信未來臺美關係會在既有互動合作的基礎上，持續鞏固深化，不會受到任何變數的影響。
三、穩定兩岸關係
面對兩岸關係的變化，總統重申，維持兩岸關係的穩定，是兩岸共同的利益；兩岸雙方應本於相互尊重、善意理解的態度，共同討論和平相處之道、共存之方；我們願意在符合對等尊嚴的原則下，共同促成兩岸之間有意義的對話；希望北京當局也能負起相對的責任，及早促其實現。
四、國內政經穩定及安全
總統指示，為避免外在因素影響治安與社會秩序，海巡署、警政署等相關部門，應確實做好維護社會治安、防範虛假訊息散布、強化基礎設施安全防護等工作，有力維護我國民主制度與自由生活的方式。
五、未來經濟發展
總統也指示，財經部會要特別注意美國總統大選後金融市場及經濟情勢的變化，並加強落實對受疫情影響產業的紓困措施，重大投資計畫及基礎建設計畫要加速推動，以強化經濟應變能力。
在供應鏈重整方面，總統強調，未來應在「5+2產業創新」、「六大核心戰略產業」、兆元投資計畫的基礎上，加速推動國內產業轉型升級；並配合「新南向政策」及和主要貿易夥伴雙邊、多邊經貿合作，協助供應鏈的海外佈局。
總統也再次強調，要深化臺美經濟合作。在8月28日宣布放寬美豬、美牛進口政策後，除了第一時間美國副總統、美國國務卿、美國跨黨派國會議員，以及臺美產業界以各種管道，公開、積極回應支持深化經濟合作以外；國務次卿柯拉克也在日前訪臺，臺美雙方就各項經濟議題進行廣泛意見討論；乃至美國參議院跨黨派、過半的參議員，聯合致函美國貿易代表署，呼籲行政部門應展開與臺灣洽簽「雙邊貿易協議」 (BTA) 的談判等，都是因為臺灣願意面對問題、解決問題，展現重建國際信用決心，而推動的實質進展。相信臺美貿易談判在這些進展的基礎上，可以持續累積前進的動能，俟時機成熟，自可水到渠成。
最後，總統也表示，除依據蘇院長上週四在行政院院會指示，加強在策略性領域的供應鏈合作之外，也要積極落實召開「臺美經濟對話」，爭取恢復「臺美貿易暨投資架構協定」（TIFA）商談，及開啟「臺美雙邊貿易協定」（BTA）諮商，為雙方合作奠定制度化基礎。同時，也要充分利用「臺美基礎建設融資及市場建立合作架構」，積極推動臺美在新南向及中南美國家建立供應鏈合作網路。
今天出席是項會議的，除了總統、副總統與行政院蘇貞昌院長、行政院沈榮津副院長，並有總統府李大維秘書長、國安會顧立雄秘書長、行政院鄧振中政務委員、行政院龔明鑫政務委員、內政部徐國勇部長、外交部吳釗燮部長、國防部嚴德發部長、參謀總長黃曙光、經濟部王美花部長、陸委會陳明通主委、海委會李仲威主委、國安局邱國正局長、駐美代表蕭美琴、國安會諮詢委員傅棟成、國安會諮詢委員陳俊麟、海基會詹志宏副董事長兼秘書長，及警政署陳家欽署長等。
而在會議開始之前，總統也帶領全體與會人員，向日前F-5E墜機事故不幸殉職的朱冠甍上尉默哀致敬。總統並在會議結束後，隨即前往臺東，向家屬表達慰問致意。
有關長榮大學馬來西亞學生遇害案，總統在會中也特別表達高度關注，除了向學生家人致上最深的哀悼，也請政府相關部門全力協助家屬辦理各項後續事宜。
對於馬來西亞學生在我國受害，總統也向學生家屬、馬國人民表達至深歉意。總統認為，臺灣應該是最友善安全的國度，發生這樣的不幸事件，不僅對臺灣的國際形象有莫大傷害，更代表我們在社會安全的維持上出現了漏洞，必須徹底檢討，確保這樣的不幸不再發生。
另外，針對昨（30）日土耳其愛琴海地區發生強烈地震，造成相當災情。對此，總統在得知後相當關心，除了指示外交部儘速了解我國僑民的安全情形，總統也請外交部轉達她與臺灣人民對土耳其人民的關切及慰問，盼望受災地區早日復原，臺灣也非常願意提供各項可能的協助。